STMIK NH menyadari bahwa laboratorium merupakan sarana penting dalam proses pembelajaran yang berkualitas. Karenanya, STMIK NH telah dan akan terus berkomitmen untuk meningkatkan kualitas dan kapasitas laboratorium. Saat ini Laboratorium dikelola dan dipakai bersama-sama oleh lebih dari satu program studi.

STMIK NH memiliki 4 laboratorium yaitu Laboratorium Multimedia (LM), Laboratorium Pemograman Dasar (LPD), Laboratorium Pemograman Lanjut (LPL), Laboratorium Grafis (LG). Laboratorium-laboratorium ini digunakan untuk praktikum, kegiatan kelompok studi, pelaksanaan workshop, pengabdian masyarakat dan penelitian-penelitian yang dilakukan oleh dosen dan mahasiswa.